遥远的恐龙时代，被称为星际病害随着陨石到地球。就连恐龙也被他们消灭。但是有一群幸存下来经由神圣之力而进化的恐龙在历经奋战后，将邪恶首脑冰冻封印拯救地球。之后它们就与贤神托林以及认同的勇者继续守护世界。随着时间的流逝，被封印的宿敌苏醒。面对地球上的生命被消灭的危机，在托林的努力下，五名勇者集结组成队伍，透过寄宿着恐龙灵魂的“兽电池”来驱动的“兽电龙”一同努力对抗邪恶军团！
大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，亚古兽战败后称大门大 为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DATS他就可以跟数码世界的强敌战斗，大因此加入DATS，与淑乃及托玛组成小组，一同解决数码事件。托玛发现日本的数码事件频率增加并非偶然，因此请假回到欧洲调查，发现根源来自于人类的七宗罪。而比丘兽的事情让大他们知道了其幕后黑手是究极体数码兽——墨丘利兽搞的鬼，也因此决定动身前往数码世界。而在数码世界，他们见到了一个人类小孩——郁人，他自称数码兽，对人类怀有怨恨。
不死者之魔王雷欧尼斯为了日后将会迎来的决战而将自身的灵魂封印了。然而他在1000年后再度醒来时，不知为何却变成了10岁少年的模样！？被隶属于〈圣剑学院〉的美少女利瑟莉娅所保护的雷欧尼斯，在对这个变得截然不同的世界一头...
本作围绕着高中生的日常生活，讲述了在“炼金术”盛行的时代中，青年人们为了守护正义...
双眼失明的少年库诺的目标，就是用水系魔术做出新的双眼。学习魔法仅仅五个月，就超越教师实力的库诺，在这前所未有的挑战中，更加绽放了才能！用魔力感知周遭的色彩、透过水系魔术的应用，制作出怀炉与敷布，甚至只用初级魔术就重现了一只猫──其技术与构思，连宫廷魔术师都瞠目结舌，实力受到赏识的库诺，就此成为拥有极致手艺的魔技师的弟子！？以好奇心开拓世界，天才少年的发明奇幻故事！
